日本列島はその70％が豊かな樹林帯に恵まれ地層も砂礫岩、花崗岩、安山岩、地域によっては石灰岩で比較的奇麗な軟水が多いです。近年地球温暖化による水の環境の変化と共に化学物質、有機物が多くなり、農業の発展と共に亜硝酸態窒素、工業の発展と共に有機溶剤（トリクロロエチレン）、水道水においてもフッ素有機化合物PFO,PFASなど、塩素でも死なない原虫（クリプトスポルジュウム）も発生しており対策が急がれていますがインフラが遅れているのが現状です。